Первоначальная церковь на месте нынешней базилики была построена в конце V века. В 977 году церковь святого Вонифатия была передана папой Бенедиктом VII бежавшему от мусульманских притеснений митрополиту Сергию Дамасскому. Сергий основал здесь монастырь, в котором жили монахи греческого и латинского обряда. В 986 году монастырский храм был освящен уже в честь двух святых – Вонифатия и Алексия. В понтификат Гонория III (1216-1227), происходившего из знатной римской семьи Савелли, владевшей близлежащей крепостью Рокка-Савелли, церковь была перестроена в трехнефную базилику, боковые нефы которой были отделены от основного аркадами, опирающимися на восемь колонн с каждой стороны.
В 1426 году монастырь и базилика были переданы папой Мартином V ордену иеронимитов-обсервантов, которые владели ими в течение последующих четырех веков. В 1587 году базилика была возведена в ранг кардинальской, то есть её титулярными наместниками становятся исключительно кардиналы. Свой нынешний вид базилика святых Вонифатия и Алексия приобрела в результате значительной перестройки, предпринятой иеронимитами в преддверии юбилейного 1750 года и завершенной в 1755 году.
Работы велись по проекту Джованни Баттиста Нолли (1701-1756) из Комо, а после его смерти были завершены римским архитектором Томмазо де Марки (1693-1759). Были реставрированны старинные окна, украшены витражи и светильники. Также были сохранены крипта и колокольня XII-XIII веков, а также венчающий тимпан византийский крест X века.
Адрес: 23 Piazza Sant Alessio
Метро: Circo Massimo или Piramide